我和他们签了协议，他们让我赔偿违约金合法吗

不想去铁路工作，单位要求赔偿违约金可能合法。依据《中华人民共和国劳动合同法》，若协议中有培训服务期或竞业限制的违约金约定，且你违反，则需支付。不及时处理可能导致法律纠纷及额外经济损失。
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处理此类问题，常见方式有协商、调解、仲裁、诉讼。应先尝试与单位协商，若不成可考虑调解；协商调解均无果，则申请劳动仲裁；对仲裁结果不满，可提起诉讼。
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不想履行协议需处理。操作如下：1.查看协议，确认是否有违约金条款及合法性；2.与单位沟通，表达意愿并协商解决方案；3.若协商无果，考虑向劳动仲裁机构申请调解或仲裁；4.保留所有证据，以备不时之需。